酶標儀廣泛地應用在臨床檢驗、生物學研究、農業科學、食品和環境科學中，特別在近幾年中，由于大量的酶聯免疫檢測試劑盒的應用，使得酶標儀在生殖保健領域中應用越來越廣泛，同時促進了生殖健康技術水平提高。

    目前國內許多計生站系統開展了酶免檢測項目，如：乙肝五項、艾滋病檢測、優生優育系列檢測、激素檢測等。過去多數采用目測方法，報出的結果缺乏科學的依據。例如：某弓形蟲檢測試劑盒中，臨界值規定為：陰性對照品的OD值×2.5，通過目測無法判斷標本孔的反應顏色是否超過臨界值。肉眼進行兩孔之間的顏色比較可能還行，但比較一孔的顏色是否超過另一孔顏色的2.5倍就不可能。

    國內多家機構，如衛生部臨床檢驗中心和計劃生育系統等多次強調酶標儀的重要性，并要求酶聯免疫檢測試劑應使用酶標儀判讀，酶免試劑的質控也應使用酶標儀，并提供酶標儀測定的原始數據，而各廠家的試劑盒說明書沒有是讓用目測的。同時酶免檢測的項目往往是一些實質性的感染和病變（如：肝炎、艾滋病、優生優育等），判讀更要求嚴謹，由誤診引起的糾紛很難處理。另外，住院手術病人術前的丙肝、艾滋等EIA試劑檢測是避免因輸血引起感染引發的醫療事故糾紛的必要手段，正逐漸被許多單位所采用。